一时之间，朝堂上大部分官员纷纷罢朝，只剩下李义府、许敬宗等零星几个反对长孙无忌的大臣。废后一事再次遭到长孙无忌的反对，李治束手无策。此时武则天想到了装病没有上朝的司空大人李勣，便和李治到李勣的府上，要听取他的意见，李勣回答，这是皇上的家务事，何必再问外人的意见。有了李勣的支持，再加上李义府和许敬宗等大臣的奏折，王皇后、萧淑妃终于被废为庶人，武则天被立为皇后。武则天举行了盛大的册封皇后典礼，故意让反对自己当皇后的韩瑗、来济两位大人来主持仪式，她要通过这一手，来让反对她的人明白，从此以后，朝廷里她了算。韩瑗等人自然知道武则天的用心，都胆战心惊。为树立自己的威望，武则天还要求在册封仪式结束后，接受文武百官朝拜。看着山呼皇后千岁，跪倒一地的众大臣，武则天流泪了，从第二次进宫到立为皇后，她终于取得重大胜利，实现了自己的梦想。但长孙无忌等人的势力毕竟还存在，朝中的许多大臣也在看着武则天有什么作为。
武则天当皇后以后，首先便拿自家兄弟开刀。武则天的两个同父异母兄弟在武则天父亲死后，对武则天母女很不好，使两人受尽欺凌。武则天当了皇后之后，几个兄弟也都沾光升了官。不料，武氏兄弟并不买账，觉得他们当官是因为是功臣之后，现在靠亲戚关系升官，并不感到荣幸。武则天马上抓住机会，向李治上奏本，把武氏兄弟贬完偏远之地，树立了自己贤德皇后的名声，而朝中大臣也对武则天刮目相看。武则天为宣扬自己的功德，又特意撰写了《外戚诫》，提出要约束外戚，防止历代出现的外戚之祸，让大唐长治久安。武则天的威望一下子得以提高。武则天当上皇后之后开始强势干政，甚至帮助李治批阅奏折。受到冷落的李治便又到韩国夫人那里去寻找慰藉。一天李治路过冷宫听到王皇后和萧淑妃的喊叫声，便前往探望。王皇后和萧淑妃被关在肮脏的屋，吃的都是残菜剩饭，李治不由伤心流泪，答应改善她们的处境，并答应让太医去给他们看病。皇后被废后，太子忠十分害怕，担心武则天会杀了他，便与他的老师上官仪商议，上官仪建议太子忠当着皇上的面请求退位。李治并没有同意，而是让太子忠偷偷去探望王皇后、萧淑妃。太子忠这时才14岁，害怕得罪武则天，心惊胆战，见了王皇后一面后赶紧溜走。寿太医来到冷宫之后，废皇后和废淑妃设计让寿太医偷偷下药毒害代王李弘，但被武则天发现了。武则天将计就计，来到李弘的房间，在李弘睡觉之际将窗户打开。